2006年，与董洁主演电影《唐布拉之恋》。

2009年，秦昊凭借主演娄烨的《春风沉醉的晚上》第二次入围戛纳，获得最佳男主角提名。

2010年11月5日，与王学圻、子义、王奎荣等主演的电影《日照重庆》在中国上映。秦昊在剧中出演了一个80后，并且饰演的角色就叫昊子，在夜店当舞者，为此，秦昊还下大力气练了一把钢管舞。

2011年9月30日，参与拍摄的电影《第一大总统》在中国上映，在剧中饰演张继。12月15日，参与拍摄由张艺谋执导电影《金陵十三钗》在中国上映，在剧中饰演教导队战士 。

2012年3月23日，与倍赏千惠子、中泉英雄、张钧甯等主演的电影《初到东京》在中国上映，在片中饰演一位到日本学习围棋的中国青年。3月31日，与莫小棋、刘诗诗、朴熙植等主演的电影《下一个奇迹》在中国上映，秦昊在剧中饰演身患忧郁症的Rocky。10月19日，与郝蕾、齐溪、瞿颖等主演的电影《浮城谜事》在中国上映。12月31日，与徐娇、秦子越、梁家仁等主演的电影《玩命时光》在中国上映，秦昊主演一位性格古怪、自闭的“屌丝男”，在片中开始尝试动作戏，完全颠覆以前的文艺范儿。

2013年7月13日，与佟大为、甘薇、乔任梁等主演的电影《十二星座离奇事件》在中国上映。7月31日，与田原等主演的短片《威尼斯70周年：重启未来》在意大利上映。10月5日，与李小冉、李保田、杨心仪等主演的电影《夜莺》在韩国上映，秦昊在剧中饰演从农村来到北京工作的朱志根（李保田饰）儿子崇义。同年，主演电影《长江图》，在剧中饰演一位诗人船长，借一条轮船溯江而上，穿越无数烟波浩渺和巴山夜雨 。

2014年1月10日，与潘粤明、吕聿来、张晓晨等主演的电影《怒放之青春再见》在中国上映，秦昊在剧中饰演一个比较“矫情别扭”的男人郑天亮（中年）。2月10日，与郭晓冬、黄轩等主演的电影《推拿》在柏林首映，秦昊在剧中饰演盲人角色，为了力求逼真完美他的眼妆则需要花一个小时才能得以完成。9月4日下午，秦昊与吕中等主演的电影《闯入者》在威尼斯电影节举行了官方首映，该片由导演王小帅执导。9月5日，与高圆圆、谢霆锋等主演的电影《一生一世》在中国上映，秦昊在片中饰演一位艺术气质浓厚的画家，为高圆圆亲手画像，是谢霆锋的强劲情敌 。10月1日，秦昊出演的电视剧《风中奇缘》在中国首播。同年，与宋慧乔、窦骁、邬君梅、陈乔恩、杨祐宁、郑元畅等主演由伊能静执导的电影《我是女王》